لجامعة محمدية مالنج أربعة مكتبات كبيرة مع الحجم الإجمالي ٥٥٨٦٫٧ متر مربعوتقع المكتبة المركزية في الجامعة الثالثة.هذه المكتبة يتكون من ثلاثة طوابق مع حجم ٤٫٦٩۰ متر مربع.  مكتبة آر فخر الدين يقع في مسجدالجامعة الثالثة بحجم ١٣٤٫٣٢متر مربع.ويقع مكتبة الجامعة الثانية في الجامعة الثانية في الشارع بيندونجان سوتامي بحجم ٧٥٠متر مربعويقع الحرم مكتبة الجامعة الأولى دراسات عليا في الشارعباندونغ رقم ١ بحجم ١٢٠٫٤متر مربع.و هناك مكتبات الكلية  كل من حجم ٦٤متر مربع.

وقد تمكنت المكتبة المركزية في جامعة محمدية مالنج من قبل أنظمة المكتبة الرقمية الني ترتبط مع العديد من المكتبات سواء في داخل البلاد أم خارج البلاد.